أحدثت المستشفى بموجب المرسوم التشريعي رقم /13/ تاريخ 1/5/1978 واعتبرت هيئة عامة بموجب القانون /23/ تاريخ 21/12/2000 ، وهي المستشفى الوحيد المتخصصة بأمراض الأطفال في سورية و تستقبل الأطفال والخدّج من جميع المحافظات وتقدم الاستشارات الطبية و الخدمات العلاجية.
الأقسام والشعب الطبية : قسم المخبر – شعبة الأمراض الإنتانية والعزل – شعبة أمراض الدم والأورام – شعبة الأمراض العامة – شعبة الأمراض الجراحية – شعبة الخديج والوليد – شعبة الإسعاف والعيادات الخارجية والإقامة المؤقتة.
كما تضم الوحدات الطبية التالية: وحدة التشريح المرضي – وحدة الأشعة – وحدة الأمراض الوراثية والصبغيات – وحدة أمراض الهضم والتنظير الهضمي- وحدة العناية المشددة- وحدة الكلية الاصطناعية- وحدة زرع الكلية.
الأجهزة الطبية المتوفرة : الحواضن الحديثة – أجهزة العناية و المراقبة – التصوير الطبقي المحوري- جهاز تخطيط دماغ فيديوي- جهاز تنظير القصبات- جهاز وظائف الرئة- جهاز الديناميكية البولية وتخطيط المثانة- جهاز تحليل الأبوال الآلي- جهاز رحلان الحموض الآمينية- جهاز التحسس الجرثومي الآلي- جهاز الإجمالي- جهاز البيولوجيا الجزئية، وغيرها من الأجهزة.
ويتم العمل على إنجاز العديد من المشاريع ومنها: مشروع أتمتة أعمال المستشفى ، مشروع مركزي زرع النقي وجراحة القلب عند الأطفال.